На сегодняшний день этот дом середины XVII века является самым старым деревянным строением города. Музей создан в 1978 году. Экспозиция открыта в 1991-м к 200-летию со дня рождения писателя. Все размещено в 14 залах и во многом следует описаниям, которые даны в книгах С. Т. Аксакова «Семейная хроника» и «Детские годы Багрова-внука».

В литературной части представлены материалы об ученическом периоде жизни Аксакова, его литературной и театрально-критической деятельности. В литературно-музыкальной гостиной воспроизведен интерьер губернаторского дома второй половины XIX века. Документальные материалы этого зала связаны с деятельностью первого Уфимского губернатора Григория Сергеевича Аксакова и его жены Софьи Александровны, по инициативе которой в 1861 году было построено здание первого уфимского театра.